Σκοπός της Η.Δ.Υ.Κ.Α. Μ.Α.Ε. είναι να παρέχει υποστήριξη κυρίως των Υπουργείων Ψηφιακής Διακυβέρνησης, Υγείας, Εργασίας και Κοινωνικής Ασφάλισης, Κοινωνικής Συνοχής και Οικογένειας και των λοιπών Υπουργείων και φορέων του δημόσιου τομέα, σε θέματα Συστημάτων Πληροφορικής, ψηφιακής τεχνολογίας, επικοινωνίας, ηλεκτρονικής διακυβέρνησης, ηλεκτρονικών υπηρεσιών και νέων και ανοικτών τεχνολογιών, σε όλους τους τομείς αρμοδιοτήτων τους, καθώς και μελέτη, ανάπτυξη, λειτουργία, εκμετάλλευση, διοίκηση, διαχείριση, παρακολούθηση και συντήρηση Συστημάτων Πληροφορικής και Επικοινωνιών, εξοπλισμού, λογισμικού και υπηρεσιών για την εξυπηρέτηση όλων των ως άνω Υπουργείων και φορέων».